28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0675 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0675  TadE family protein  100 
 
 
153 aa  291  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  39.84 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  36.51 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  41.79 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0838  TadE family protein  38.94 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0630609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  41.8 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3423  TadE family protein  39.26 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3130  hypothetical protein  42.02 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607082 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  30.83 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  38.66 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  37.23 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4722  hypothetical protein  32.61 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.238789  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4036  hypothetical protein  33.62 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.28497  hitchhiker  0.00942357 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  35.71 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  34.86 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1545  hypothetical protein  32 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  26.81 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  39.62 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  39.34 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1733  hypothetical protein  30.36 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0064248  normal  0.12114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1227  hypothetical protein  32.99 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  hitchhiker  0.00933238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2479  TadE family protein  28.71 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134172 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  39.22 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  39.22 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  39.22 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  39.22 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  39.22 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  39.22 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>