20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2762 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  618  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  92.68 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  54.55 
 
 		 314 aa  325  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  41.37 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  39.67 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0760  hypothetical protein  38.33 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000614648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2609  hypothetical protein  31.44 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.051078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  27.24 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  31.27 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  28.81 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  24.59 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3543  hypothetical protein  25.08 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2536  hypothetical protein  26.52 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000281952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4011  hypothetical protein  24.47 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0458856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  24.32 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  22.41 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5264  hypothetical protein  19.73 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2444  hypothetical protein  25.29 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2821  hypothetical protein  26.16 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>