17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0554 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  87.18 
 
 		 476 aa  818    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  971    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  44.6 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  42.97 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  40.78 
 
 		 510 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  39.22 
 
 		 505 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  34.44 
 
 		 510 aa  266  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  38.18 
 
 		 376 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  28.51 
 
 		 498 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  27.31 
 
 		 568 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  26.27 
 
 		 565 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  22.97 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  19.36 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  22.46 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  21.91 
 
 		 558 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  21.48 
 
 		 554 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  22.71 
 
 		 561 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>