22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2377 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  100 
 
 		 388 aa  805    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  68.56 
 
 		 386 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  42.81 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.57 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.28 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.61 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.33 
 
 		 1034 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.25 
 
 		 1034 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.15 
 
 		 1074 aa  59.7  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  24.24 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.76 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.76 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.76 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.51 
 
 		 500 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.88 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.77 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.94 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  25.58 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.92 
 
 		 440 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  26.53 
 
 		 351 aa  46.6  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  27.01 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.75 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>