21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1478 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  620  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  92.68 
 
 		 314 aa  559  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  54.66 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  41.03 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  40.97 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0760  hypothetical protein  38.61 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000614648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2609  hypothetical protein  32.79 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.051078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  26.56 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  33.14 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  28.08 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  29.32 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  25.43 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  24.83 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2536  hypothetical protein  26.62 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000281952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4011  hypothetical protein  23.68 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0458856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  22.41 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3543  hypothetical protein  25.08 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2444  hypothetical protein  27.89 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2821  hypothetical protein  27.89 
 
 		 193 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2459  hypothetical protein  25.77 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5264  hypothetical protein  22.37 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>