25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0623 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  100 
 
 		 78 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  93.59 
 
 		 78 aa  156  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  49.35 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  44.16 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  46.05 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  46.58 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  32.93 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  27.27 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  38.55 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  32.08 
 
 		 817 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  32.08 
 
 		 817 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  48.94 
 
 		 785 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 814 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  32.08 
 
 		 804 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  36.17 
 
 		 787 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 		 777 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  39.58 
 
 		 902 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  32.5 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1187  TRASH domain-containing protein  33.72 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 		 796 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  36.59 
 
 		 389 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0249  hypothetical protein  29.51 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  36.73 
 
 		 798 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 		 835 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  28.57 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>