18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0567 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  968    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  87.18 
 
 		 476 aa  823    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  43.53 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  44.72 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  42.77 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  39.57 
 
 		 505 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  34.89 
 
 		 510 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  37.5 
 
 		 376 aa  223  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  29.05 
 
 		 498 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  27.49 
 
 		 565 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  27.27 
 
 		 568 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  23.24 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  23.43 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  20.09 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  20.12 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  20.87 
 
 		 554 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  21.77 
 
 		 561 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  19.31 
 
 		 555 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>