26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5413 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5413  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2601  hypothetical protein  68.28 
 
 
313 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00160673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4098  hypothetical protein  61.06 
 
 
319 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0491  hypothetical protein  59.47 
 
 
303 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8237  hypothetical protein  50.97 
 
 
331 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2529  hypothetical protein  44 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3496  hypothetical protein  43.15 
 
 
315 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0101  hypothetical protein  41.84 
 
 
313 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170875  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1224  hypothetical protein  41.89 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1972  hypothetical protein  40.97 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2080  hypothetical protein  41.28 
 
 
313 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246474  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2833  hypothetical protein  41.78 
 
 
294 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000938747  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0564  hypothetical protein  39.67 
 
 
314 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1102  hypothetical protein  40 
 
 
313 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1470  hypothetical protein  38.41 
 
 
318 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1804  hypothetical protein  37.79 
 
 
320 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0532  hypothetical protein  38.33 
 
 
314 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0722  hypothetical protein  39.8 
 
 
322 aa  189  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480992  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0561  hypothetical protein  38.56 
 
 
314 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2490  hypothetical protein  39.38 
 
 
321 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0547  hypothetical protein  40.62 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1866  hypothetical protein  38.82 
 
 
305 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1972  hypothetical protein  32 
 
 
307 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0967  hypothetical protein  71.01 
 
 
114 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3033  hypothetical protein  26.48 
 
 
295 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00644621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1603  hypothetical protein  25.08 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0178539  hitchhiker  0.0000000381472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>