More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3993 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  587  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0331  hypothetical protein  80.07 
 
 		 286 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.220687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0323  hypothetical protein  80.07 
 
 		 287 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  68.18 
 
 		 287 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  50.7 
 
 		 285 aa  292  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.61 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.51 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.83 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.13 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.82 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.76 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  41.49 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.2 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.85 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  40.99 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5597  hypothetical protein  43.36 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  40.85 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  39.86 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  40.7 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1033  hypothetical protein  43.86 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  40.75 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  42.2 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4026  hypothetical protein  42.2 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.72 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.11 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  41.61 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  38.73 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  38.73 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  37.85 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  36.88 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  39.59 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  37.21 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  38.73 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  39.02 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  36.59 
 
 		 345 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.08 
 
 		 308 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  37.24 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.09 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  35.98 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  36.9 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  36.9 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  35.83 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  37.32 
 
 		 284 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  37.32 
 
 		 284 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  37.32 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.28 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  38.01 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  39.73 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  36.89 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2849  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  36.89 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0980884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3751  fructose-bisphosphate aldolase, class II  37.2 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.98 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105194  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  36.46 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  37.1 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  39.38 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.95 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  39.38 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  38.83 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  39.38 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.44 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  39.38 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  39.38 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  39.38 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  39.38 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  39.38 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.24 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.59 
 
 		 345 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.44 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  39.04 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  36.88 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.56 
 
 		 349 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  36.52 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  34.97 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  34.74 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2058  fructose-bisphosphate aldolase, class II  37.41 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  hitchhiker  0.00173454 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  35.05 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3041  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.76 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3047  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.76 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  34.74 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  34.74 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0163  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  33.84 
 
 		 355 aa  175  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0408428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  34.74 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  34.74 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  34.74 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  34.74 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  34.74 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  34.25 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  36.68 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01742  predicted aldolase  36.81 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.665846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1869  ketose-bisphosphate aldolase  36.81 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00279551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4960  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.95 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2497  fructose-bisphosphate aldolase, class II family  36.81 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1857  fructose-bisphosphate aldolase  36.81 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00760876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01730  hypothetical protein  36.81 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.843477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1997  fructose-bisphosphate aldolase, class II  36.81 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2844  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.45 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1859  ketose-bisphosphate aldolase  36.81 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.175434  decreased coverage  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4833  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.95 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.56 
 
 		 354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0506  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.65 
 
 		 354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>