63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2485 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2485  penicillin-insensitive murein endopeptidase  100 
 
 		 274 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2623  penicillin-insensitive murein endopeptidase  98.91 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1324  penicillin-insensitive murein endopeptidase  98.91 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1328  peptidase U6 penicillin-insensitive murein endopeptidase  98.54 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2480  penicillin-insensitive murein endopeptidase  98.54 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2706  penicillin-insensitive murein endopeptidase  98.54 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3469  penicillin-insensitive murein endopeptidase  98.18 
 
 		 274 aa  552  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02253  penicillin-insensitive murein endopeptidase  98.18 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02213  hypothetical protein  98.18 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2736  penicillin-insensitive murein endopeptidase  89.78 
 
 		 274 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2523  penicillin-insensitive murein endopeptidase  89.78 
 
 		 274 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2612  penicillin-insensitive murein endopeptidase  89.78 
 
 		 274 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2572  penicillin-insensitive murein endopeptidase  89.78 
 
 		 274 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2625  penicillin-insensitive murein endopeptidase  89.42 
 
 		 274 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644795  hitchhiker  0.000000497544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2876  penicillin-insensitive murein endopeptidase  87.96 
 
 		 274 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0818548  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1515  penicillin-insensitive murein endopeptidase  72.45 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0376  penicillin-insensitive murein endopeptidase  72.45 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1406  penicillin-insensitive murein endopeptidase  70.96 
 
 		 275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.277424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2592  penicillin-insensitive murein endopeptidase  72.06 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2810  penicillin-insensitive murein endopeptidase  69.78 
 
 		 281 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1454  penicillin-insensitive murein endopeptidase  71.32 
 
 		 281 aa  394  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1346  penicillin-insensitive murein endopeptidase  68.91 
 
 		 269 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3373  penicillin-insensitive murein endopeptidase  68.38 
 
 		 275 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1204  penicillin-insensitive murein endopeptidase  50.18 
 
 		 279 aa  275  8e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004390  murein endopeptidase  45.9 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01020  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.85 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0560  penicillin-insensitive murein endopeptidase  49.12 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3484  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.7 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.395907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1139  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.7 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0305084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2176  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.7 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5739  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.32 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3607  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.25 
 
 		 309 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3098  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.92 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0543  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.89 
 
 		 294 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3284  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.8 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6120  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.92 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0985  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.67 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1047  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.27 
 
 		 340 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0158  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.34 
 
 		 317 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0450  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.04 
 
 		 318 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.0724042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4516  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.18 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3296  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.8 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00347762 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0341  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.7 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0051  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.33 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0581  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.66 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.29607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1334  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.81 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0437  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.92 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7377  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.39 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1690  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.82 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2659  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.06 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3596  penicillin-insensitive murein endopeptidase  35.82 
 
 		 345 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0394  penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.64 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3367  penicillin-insensitive murein endopeptidase  37.4 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0241  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.28 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4445  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.53 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.710373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4131  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.07 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0461915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2663  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.8 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0344  penicillin-insensitive murein endopeptidase  37.22 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0021  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.36 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3338  penicillin-insensitive murein endopeptidase  34.62 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1363  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.14 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0031  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.14 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.98 
 
 		 377 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>