17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0016 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0016  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  867  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.969858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0040  hypothetical protein  66.5 
 
 
417 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.204135  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0041  putative cytoplasmic protein  64.48 
 
 
415 aa  576  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.241451 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0042  putative cytoplasmic protein  64.48 
 
 
415 aa  575  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.315374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0042  putative cytoplasmic protein  64.72 
 
 
415 aa  577  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.814834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0040  hypothetical protein  64.72 
 
 
415 aa  576  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  hitchhiker  0.00714315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1508  putative cytoplasmic protein  36.19 
 
 
414 aa  244  2e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.371174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4387  hypothetical protein  24.75 
 
 
375 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4435  hypothetical protein  22.33 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4438  hypothetical protein  22.33 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4321  putative cytoplasmic protein  21.83 
 
 
374 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001248  hypothetical protein  21.85 
 
 
489 aa  79  1e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27761  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05117  hypothetical protein  22.37 
 
 
489 aa  75.1  2e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4351  hypothetical protein  26.29 
 
 
348 aa  70.9  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0084  hypothetical protein  22.25 
 
 
520 aa  68.6  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332452  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0456  conserved hypothetical protein, putative transposase  22.29 
 
 
489 aa  67.4  5e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2860  hypothetical protein  24.39 
 
 
453 aa  57.8  3e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>