18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2251 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2251  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000346124  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2246  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1137  hypothetical protein  65.62 
 
 		 115 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000105893  hitchhiker  3.11479e-26 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1423  hypothetical protein  27.78 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000240373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1160  hypothetical protein  27.78 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000194771  hitchhiker  8.03326e-20 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0692  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000916381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1258  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2285  protein of unknown function DUF1019  37.89 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2809  hypothetical protein  30.21 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.543438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1509  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.633162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1150  hypothetical protein  28.74 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59138  normal  0.272741 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2277  hypothetical protein  28.12 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000286222  hitchhiker  0.0000000000000109213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1776  hypothetical protein  27.63 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1388  hypothetical protein  32.32 
 
 		 164 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.662888  hitchhiker  5.90722e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01528  hypothetical protein  27.63 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0345418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1832  hypothetical protein  27.97 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000237524  hitchhiker  0.0000000000000361033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3167  hypothetical protein  27.97 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2060  hypothetical protein  26.97 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.280149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>