12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1258 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1258  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  291  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2277  hypothetical protein  85.11 
 
 
141 aa  259  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000286222  hitchhiker  0.0000000000000109213 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1432  hypothetical protein  86.52 
 
 
141 aa  259  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000253642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1150  hypothetical protein  88.64 
 
 
132 aa  246  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59138  normal  0.272741 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1509  hypothetical protein  82.27 
 
 
141 aa  244  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.633162  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2809  hypothetical protein  82.27 
 
 
141 aa  244  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.543438  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2210  hypothetical protein  81.82 
 
 
132 aa  225  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000649524  hitchhiker  5.55598e-19 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2285  protein of unknown function DUF1019  31.25 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0692  hypothetical protein  30.56 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000916381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2246  hypothetical protein  28.42 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2251  hypothetical protein  29.17 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000346124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3235  hypothetical protein  32.53 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338161  hitchhiker  0.000443266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>