More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01786 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  100 
 
 
518 aa  1033  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1033  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  100 
 
 
518 aa  1033  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  99.61 
 
 
516 aa  1000  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.29507e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  74.71 
 
 
517 aa  728  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  90.75 
 
 
519 aa  934  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2020  Integral membrane protein TerC  71.18 
 
 
517 aa  717  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  90.94 
 
 
519 aa  935  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  90.94 
 
 
519 aa  935  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  90.94 
 
 
519 aa  935  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  90.94 
 
 
519 aa  935  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  100 
 
 
518 aa  1033  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  100 
 
 
518 aa  1033  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  72.06 
 
 
518 aa  722  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  85.55 
 
 
518 aa  897  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2367  CBS domain-containing protein  73.92 
 
 
514 aa  737  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  100 
 
 
518 aa  1033  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.47451e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
518 aa  1033  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  100 
 
 
518 aa  1033  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  71.43 
 
 
514 aa  747  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1650  CBS domain-containing protein  73.92 
 
 
522 aa  737  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  72.06 
 
 
518 aa  738  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2463  integral membrane protein TerC  73.92 
 
 
514 aa  737  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  56.1 
 
 
510 aa  577  1e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  57.03 
 
 
530 aa  568  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  54.93 
 
 
518 aa  540  1e-152  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_003296  RS05062  hypothetical protein  54.95 
 
 
526 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3379  integral membrane protein TerC  54.49 
 
 
530 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4207  Integral membrane protein TerC  55.75 
 
 
526 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110705  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4317  Integral membrane protein TerC  55.75 
 
 
526 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.67976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  52.12 
 
 
522 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  53.22 
 
 
523 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  53.22 
 
 
523 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  51.25 
 
 
522 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  53.67 
 
 
523 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  52.7 
 
 
523 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  51.35 
 
 
518 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  54.6 
 
 
515 aa  466  1e-130  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2870  integral membrane protein TerC  53.14 
 
 
522 aa  466  1e-130  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  50.98 
 
 
518 aa  467  1e-130  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  52.87 
 
 
515 aa  466  1e-130  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  50.78 
 
 
522 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  50.66 
 
 
527 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  52.25 
 
 
522 aa  455  1e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  53.03 
 
 
518 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1169  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.38 
 
 
527 aa  446  1e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0999  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.81 
 
 
527 aa  447  1e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01958  hypothetical protein  50 
 
 
527 aa  448  1e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2998  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.38 
 
 
527 aa  446  1e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.159646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2356  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 
527 aa  448  1e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  48.88 
 
 
577 aa  447  1e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01969  fused predicted membrane protein/predicted membrane protein  50 
 
 
527 aa  448  1e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  47.65 
 
 
528 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1578  integral membrane protein TerC  50.19 
 
 
527 aa  445  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1594  Integral membrane protein TerC  50.19 
 
 
527 aa  445  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12256  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0880  integral membrane protein  45.81 
 
 
527 aa  439  1e-122  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000917875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2549  integral membrane protein TerC  49.71 
 
 
528 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.584861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3192  CBS domain-containing protein  49.71 
 
 
528 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237895  hitchhiker  0.00326333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2450  CBS domain-containing protein  49.9 
 
 
528 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.889017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  49.42 
 
 
528 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  47.04 
 
 
529 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  47.33 
 
 
529 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0452  TerC family membrane protein  49.22 
 
 
444 aa  416  1e-115  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.789805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1066  Integral membrane protein TerC  50.88 
 
 
513 aa  418  1e-115  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0348  Integral membrane protein TerC  41.99 
 
 
527 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  51.67 
 
 
251 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
251 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
251 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  53.48 
 
 
271 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  51.02 
 
 
249 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  51 
 
 
250 aa  255  1e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  51.46 
 
 
254 aa  255  2e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  51.69 
 
 
247 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  51.27 
 
 
251 aa  253  5e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  50.4 
 
 
250 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  50.4 
 
 
250 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  51.69 
 
 
251 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  52.86 
 
 
267 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  53.39 
 
 
239 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4403  integral membrane protein TerC  53.33 
 
 
263 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  60.96 
 
 
255 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.4631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  49.6 
 
 
250 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  49.39 
 
 
250 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  47.76 
 
 
249 aa  246  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  50.83 
 
 
251 aa  246  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  54.94 
 
 
253 aa  245  1e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  51.05 
 
 
252 aa  244  2e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  52.23 
 
 
253 aa  244  2e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  53.36 
 
 
251 aa  244  4e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  49.79 
 
 
246 aa  244  4e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  6.14006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  51.71 
 
 
250 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  57.26 
 
 
295 aa  243  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  51.93 
 
 
249 aa  243  8e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
249 aa  243  8e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  48.12 
 
 
241 aa  242  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  48.71 
 
 
274 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  52.07 
 
 
238 aa  241  3e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  52.17 
 
 
250 aa  240  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  50.43 
 
 
241 aa  240  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  50 
 
 
259 aa  240  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>