17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0053 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0053  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  25.64 
 
 
274 aa  62  1e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  23.33 
 
 
266 aa  54.3  2e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  26.94 
 
 
239 aa  51.2  2e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.43 
 
 
265 aa  50.4  2e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  23.7 
 
 
250 aa  50.4  3e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  25.79 
 
 
246 aa  49.7  4e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
251 aa  49.3  5e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3148  hypothetical protein  24.89 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0494985  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  23.74 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  23.74 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1294  hypothetical protein  22.97 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  20.82 
 
 
271 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  20.82 
 
 
271 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3568  hypothetical protein  22.4 
 
 
248 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  25.52 
 
 
258 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>