35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0014 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3394  hypothetical protein  49.81 
 
 
795 aa  754  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0014  hypothetical protein  100 
 
 
814 aa  1657  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5512  hypothetical protein  38.15 
 
 
771 aa  446  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807443  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  38.73 
 
 
1022 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0660  hypothetical protein  31.7 
 
 
815 aa  429  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.81909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  34.03 
 
 
990 aa  429  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1751  hypothetical protein  32.04 
 
 
779 aa  400  1e-110  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1417  hypothetical protein  31.79 
 
 
779 aa  398  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.196003  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1630  hypothetical protein  33.54 
 
 
754 aa  386  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0314  hypothetical protein  32.9 
 
 
774 aa  375  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29441  hypothetical protein  35.07 
 
 
693 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0729  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  40.1 
 
 
396 aa  217  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7106  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  31.94 
 
 
414 aa  185  2e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7108  hypothetical protein  32.7 
 
 
358 aa  163  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0728  hypothetical protein  32.66 
 
 
389 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.16 
 
 
887 aa  64.7  7e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.37 
 
 
975 aa  60.8  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.43 
 
 
956 aa  58.2  7e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  25.79 
 
 
907 aa  56.2  2e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  31.77 
 
 
1240 aa  56.6  2e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.08 
 
 
971 aa  53.1  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.59 
 
 
971 aa  53.1  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  29.49 
 
 
828 aa  52  4e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.33 
 
 
950 aa  51.2  8e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.69 
 
 
692 aa  50.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0664  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  32.32 
 
 
590 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.71 
 
 
1097 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.71 
 
 
867 aa  48.5  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0750  phosphotransferase system enzyme I  31.31 
 
 
590 aa  48.5  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.49 
 
 
873 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.16 
 
 
797 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  28.82 
 
 
854 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  37.31 
 
 
971 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.79 
 
 
959 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0560  pyruvate phosphate dikinase  36.7 
 
 
856 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.433086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>