283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4370 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 47 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 48 aa  61.2  0.000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 45 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 45 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4361  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4517  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4498  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0926  50S ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 46 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 48 aa  58.2  0.00000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1043  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 46 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000531959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_914  ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 46 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000254245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1628  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.499577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1330  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1356  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0134833  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5302  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  66.67 
 
 		 51 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000418324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.398714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2334  50S ribosomal protein L34  56.82 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  58.14 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>