16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_961 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_961  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  530  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0043963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0972  membrane protein-like protein  92.96 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000387152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1143  hypothetical protein  88.93 
 
 		 273 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  36.15 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4306  hypothetical protein  41.1 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0689253  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  35.44 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04240  predicted membrane protein  34.83 
 
 		 329 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  36.88 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  27.67 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  27.67 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2198  hypothetical protein  26.21 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07980  Protein of unknown function (DUF2510)  32.17 
 
 		 354 aa  52.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0996646  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  29.02 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  28 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  30.53 
 
 		 444 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  29.17 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>