143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0007 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0007  SNO glutamine amidotransferase  100 
 
 
190 aa  384  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.789249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.11 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.71 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.17 
 
 
188 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  37.63 
 
 
194 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  35.83 
 
 
188 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  34.21 
 
 
193 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  35.83 
 
 
188 aa  121  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  34.76 
 
 
189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  36.36 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  37.37 
 
 
195 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  36.36 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  35.79 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  35.26 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  36.32 
 
 
195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  35.64 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  33.15 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  34.04 
 
 
196 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  34.04 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  34.04 
 
 
196 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  34.04 
 
 
196 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  32.26 
 
 
191 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
204 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  33.51 
 
 
196 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  33.51 
 
 
196 aa  104  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.18 
 
 
187 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  33.69 
 
 
189 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  31.58 
 
 
192 aa  101  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  33.15 
 
 
190 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  33.68 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  32.46 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  34.57 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  31.05 
 
 
190 aa  99  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  32.97 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  31.79 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  32.66 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.05 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.05 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  32.46 
 
 
198 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  29.57 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  34.21 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  33.51 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  33.51 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3580  glutamine amidotransferase subunit PdxT  32.82 
 
 
200 aa  95.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.118248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  30.89 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1871  glutamine amidotransferase subunit PdxT  33.16 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156111  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3479  glutamine amidotransferase subunit PdxT  30 
 
 
195 aa  95.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.31232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  32.98 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  32.98 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3161  SNO glutamine amidotransferase  30.11 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655935  normal  0.065831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  31.28 
 
 
219 aa  94.4  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  31 
 
 
203 aa  94.4  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  31.02 
 
 
189 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  30.32 
 
 
189 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  32.29 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  30.53 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  31.5 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  29.67 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.55 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.52 
 
 
186 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  32.63 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0040  SNO glutamine amidotransferase  31.44 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  29.9 
 
 
203 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1908  SNO glutamine amidotransferase  30.81 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  29.65 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  30.3 
 
 
211 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.44 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  30.98 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  30.98 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.12 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1110  SNO glutamine amidotransferase  29.23 
 
 
198 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00211024  hitchhiker  0.0000000000000181394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1439  glutamine amidotransferase subunit PdxT  33.15 
 
 
186 aa  87  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  30.46 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0902  glutamine amidotransferase subunit PdxT  28.72 
 
 
212 aa  85.1  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1078  glutamine amidotransferase subunit PdxT  28.88 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  29.53 
 
 
196 aa  84.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3830  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.94 
 
 
195 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  31.72 
 
 
197 aa  84.3  9e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  32.6 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.538728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  28.72 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  26.82 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  29.51 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  28.5 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  28.5 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0928  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.49 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1638  SNO glutamine amidotransferase  30.2 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0209  SNO glutamine amidotransferase  32.98 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.678757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  30 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  29.05 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  28.04 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0370  glutamine amidotransferase subunit PdxT  30.32 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1601  SNO glutamine amidotransferase  26.7 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1753  glutamine amidotransferase subunit PdxT  30.39 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.49529  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7092  predicted protein  27.57 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  25.91 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1791  SNO glutamine amidotransferase  30.96 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16453  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  27.32 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0956  glutamine amidotransferase subunit PdxT  30.39 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  24.17 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>