More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3614 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  100 
 
 
72 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  88.57 
 
 
72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  85.71 
 
 
72 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  87.14 
 
 
72 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  84.29 
 
 
72 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
72 aa  120  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  82.86 
 
 
72 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
75 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  74.29 
 
 
85 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2087  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000107784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
73 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  73.61 
 
 
73 aa  113  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  72.22 
 
 
72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
72 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
72 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1552  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  72.86 
 
 
72 aa  110  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
72 aa  110  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
72 aa  110  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  110  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0196  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
72 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  110  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  71.43 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2765  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.219281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000441165  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000185401  hitchhiker  0.0000121311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1567  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216088  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000358057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0322  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0381418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000207147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2266  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2604  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.62411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
72 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1407  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0166318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1399  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1981  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1713  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.846652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2366  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.302955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1675  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764362  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2691  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000360853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1603  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>