45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0159 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  208  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  56.48 
 
 
108 aa  112  2e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  49.04 
 
 
108 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  53.54 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  53.27 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  43 
 
 
108 aa  82  2e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  46.59 
 
 
95 aa  78.2  4e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  39.62 
 
 
116 aa  77.4  5e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 
107 aa  77  8e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  39.05 
 
 
110 aa  74.3  6e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  70.5  7e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  70.5  7e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  70.5  7e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  70.5  7e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  70.5  7e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  37.14 
 
 
103 aa  68.6  3e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  46.15 
 
 
105 aa  68.2  4e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  38.24 
 
 
103 aa  65.9  2e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  65.5  3e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  65.5  3e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  33.02 
 
 
109 aa  60.5  7e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  36.36 
 
 
103 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  36.36 
 
 
103 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  39.71 
 
 
100 aa  57.4  7e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  35.23 
 
 
103 aa  56.6  1e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2350  branched-chain amino acid transport  35.58 
 
 
107 aa  55.5  2e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.771516  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  46.67 
 
 
106 aa  53.9  7e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  37.14 
 
 
103 aa  52.8  2e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 
103 aa  49.7  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
106 aa  49.7  1e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  31.07 
 
 
107 aa  47  9e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  34.78 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  34.78 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  39.13 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  25.49 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  29.13 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  29.13 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  29.9 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0662  branched-chain amino acid transport  38.03 
 
 
101 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00834286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  38.54 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  29.59 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  27.18 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  39.13 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>