25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0869 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0869  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0551  hypothetical protein  60.27 
 
 
226 aa  279  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1610  hypothetical protein  40.45 
 
 
231 aa  178  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0940  hypothetical protein  40.91 
 
 
224 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1473  hypothetical protein  40.4 
 
 
226 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1679  hypothetical protein  29.46 
 
 
252 aa  141  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00685149  normal  0.0163026 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17570  hypothetical protein  32.29 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0106  hypothetical protein  39.13 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0440784  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0881  hypothetical protein  33.16 
 
 
228 aa  138  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1707  hypothetical protein  32.86 
 
 
241 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1402  hypothetical protein  34.9 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06710  hypothetical protein  36.08 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1044  hypothetical protein  37.44 
 
 
215 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1068  hypothetical protein  36.41 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07920  hypothetical protein  31.38 
 
 
286 aa  124  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00573747  normal  0.450178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1094  hypothetical protein  30.81 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0109  hypothetical protein  35.52 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0589  putative ATP/GTP-binding protein  35.24 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1387  putative ATP/GTP-binding protein  36.99 
 
 
229 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2126  putative ATP/GTP-binding protein  35.9 
 
 
216 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.542682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0046  hypothetical protein  32.06 
 
 
230 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0020  hypothetical protein  32.28 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.921254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0035  hypothetical protein  31.05 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2076  hypothetical protein  31.05 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0032  hypothetical protein  35.54 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000810858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>