19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1969 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1969  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2601  hypothetical protein  80.3 
 
 
66 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00023523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0591  hypothetical protein  75.76 
 
 
66 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0887  hypothetical protein  44.62 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3223  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133726  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2463  hypothetical protein  43.08 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53546  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  43.33 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  45.28 
 
 
71 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  44.83 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  44.83 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000840399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0270  hypothetical protein  45.61 
 
 
68 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.539456  normal  0.847798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1312  hypothetical protein  47.27 
 
 
60 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400189  normal  0.266192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4996  hypothetical protein  46 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565359  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2138  hypothetical protein  42.11 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.183994  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3628  hypothetical protein  45.1 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2867  hypothetical protein  47.73 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0589  hypothetical protein  38.46 
 
 
64 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112299  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3626  hypothetical protein  38.78 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2137  hypothetical protein  30.43 
 
 
87 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.802292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>