44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1934 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1934  S23 ribosomal protein  100 
 
 		 85 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285916  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1960  S23 ribosomal protein  93.42 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1949  S23 ribosomal protein  93.42 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.512605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1940  S23 ribosomal protein  93.42 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0249687  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1973  S23 ribosomal protein  73.68 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174055 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1904  S23 ribosomal protein  71.05 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2609  S23 ribosomal protein  67.11 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.839204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1768  S23 ribosomal protein  62.67 
 
 		 127 aa  93.6  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1181  S23 ribosomal protein  50 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1495  S23 ribosomal protein  48 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0834  S23 ribosomal protein  52.46 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.530691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0863  S23 ribosomal protein  40.3 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4127  hypothetical protein  45.31 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3212  S23 ribosomal protein  41.79 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0809  S23 ribosomal protein  38.81 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4428  glutamine--scyllo-inositol transaminase  44 
 
 		 583 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2787  hypothetical protein  38.24 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000122053  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0797  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2269  S23 ribosomal protein  44.78 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3034  S23 ribosomal protein  44.29 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0925  S23 ribosomal protein  36.59 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0667  S23 ribosomal protein  40.51 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1770  hypothetical protein  38.1 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00388506  normal  0.0836423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1383  hypothetical protein  37.7 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2569  S23 ribosomal protein  40.26 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3192  hypothetical protein  36.23 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2958  hypothetical protein  37.7 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2542  hypothetical protein  36.07 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2821  hypothetical protein  33.77 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1316  hypothetical protein  36.07 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0254819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1652  hypothetical protein  34.43 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2891  hypothetical protein  40.26 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0159035 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  28.38 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2670  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2263  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  decreased coverage  0.000429969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2842  hypothetical protein  36.07 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.578199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1396  hypothetical protein  38.16 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3035  S23 ribosomal  34.21 
 
 		 109 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.964559  hitchhiker  0.00587494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0782  S23 ribosomal protein  44.78 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.653003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3825  hypothetical protein  43.24 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.169171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  39.24 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1864  S23 ribosomal protein  32.35 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.508556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1780  hypothetical protein  35.37 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>