24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1053 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  333  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  62.42 
 
 
165 aa  225  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  63.8 
 
 
163 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  43.37 
 
 
167 aa  140  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  40.12 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  40.49 
 
 
182 aa  121  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  32.12 
 
 
169 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1183  hypothetical protein  40.96 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  31.68 
 
 
171 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  31.29 
 
 
185 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  28.93 
 
 
201 aa  85.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3816  hypothetical protein  29.19 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3866  hypothetical protein  29.19 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2957  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000744507  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0098  hypothetical protein  29.94 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0139  hypothetical protein  31.65 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  27.67 
 
 
657 aa  64.7  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  33.77 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3638  hypothetical protein  22.58 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  29.11 
 
 
245 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  32.35 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  22.93 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21610  hypothetical protein  27.08 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.281638  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3282  hypothetical protein  24.39 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>