19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2601 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2601  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  133  7e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00023523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0591  hypothetical protein  95.45 
 
 
66 aa  129  1e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1969  hypothetical protein  80.3 
 
 
66 aa  109  2e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0887  hypothetical protein  49.23 
 
 
66 aa  75.5  2e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3223  hypothetical protein  44.62 
 
 
66 aa  68.9  2e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133726  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2463  hypothetical protein  43.08 
 
 
70 aa  63.5  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53546  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1312  hypothetical protein  50.91 
 
 
60 aa  57.8  5e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400189  normal  0.266192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4996  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  57  9e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565359  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  44.07 
 
 
70 aa  55.5  2e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  38.46 
 
 
65 aa  52.4  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  38.46 
 
 
65 aa  52.4  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  8.40399e-09 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  41.51 
 
 
71 aa  52  3e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2867  hypothetical protein  42.37 
 
 
78 aa  50.1  1e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0270  hypothetical protein  46.15 
 
 
68 aa  48.1  4e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.539456  normal  0.847798 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3628  hypothetical protein  45.1 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3626  hypothetical protein  44 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0589  hypothetical protein  38.89 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112299  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2138  hypothetical protein  41.07 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.183994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0573  hypothetical protein  39.62 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>