More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1488 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  78.83 
 
 
496 aa  812    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0788  IMP dehydrogenase  86.72 
 
 
497 aa  855    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0489  IMP dehydrogenase  85.28 
 
 
497 aa  848    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
497 aa  1004    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  63.82 
 
 
484 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  81.05 
 
 
496 aa  829    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  86.49 
 
 
497 aa  883    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1790  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  85.28 
 
 
499 aa  844    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.01 
 
 
488 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.14 
 
 
504 aa  632  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.66 
 
 
488 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.59 
 
 
488 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.26 
 
 
490 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.13 
 
 
485 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.6 
 
 
485 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.94 
 
 
486 aa  607  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.54 
 
 
486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.68 
 
 
493 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.12 
 
 
489 aa  599  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.66 
 
 
491 aa  601  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.03 
 
 
486 aa  595  1e-169  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  58.33 
 
 
490 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  58.45 
 
 
490 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.94 
 
 
485 aa  595  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.57 
 
 
489 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4441  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.65 
 
 
490 aa  594  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.92 
 
 
484 aa  595  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  60.86 
 
 
484 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0196  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.94 
 
 
490 aa  592  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2558  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.35 
 
 
484 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.94 
 
 
484 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.82 
 
 
487 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 
487 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.1 
 
 
490 aa  588  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 
487 aa  589  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 
484 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.61 
 
 
491 aa  589  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.03 
 
 
491 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.93 
 
 
486 aa  589  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
483 aa  590  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.4 
 
 
488 aa  591  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.1 
 
 
556 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 
487 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.82 
 
 
487 aa  588  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.76 
 
 
508 aa  588  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 
487 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.03 
 
 
487 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.82 
 
 
487 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.03 
 
 
487 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.88 
 
 
488 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.03 
 
 
487 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.23 
 
 
487 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  58.37 
 
 
486 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.03 
 
 
487 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.82 
 
 
487 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.51 
 
 
489 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1594  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.85 
 
 
489 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.03 
 
 
487 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 
491 aa  587  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.9 
 
 
489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.38 
 
 
489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.42 
 
 
491 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.1 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.91 
 
 
486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.04 
 
 
485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.3 
 
 
486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.18 
 
 
483 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.22 
 
 
487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.01 
 
 
490 aa  584  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.54 
 
 
487 aa  578  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.2 
 
 
490 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.12 
 
 
489 aa  581  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.17 
 
 
489 aa  578  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  581  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.78 
 
 
482 aa  578  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.89 
 
 
486 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.5 
 
 
486 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.82 
 
 
487 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.15 
 
 
493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.78 
 
 
482 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1620  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.58 
 
 
489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.59 
 
 
487 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.89 
 
 
486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.06 
 
 
485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.86 
 
 
485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4148  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.5 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0201579  normal  0.112689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.16 
 
 
484 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.91 
 
 
494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.8 
 
 
493 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>