18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1153 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1153  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  decreased coverage  0.0000174262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3784  hypothetical protein  37.5 
 
 
553 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0341  hypothetical protein  36 
 
 
335 aa  59.3  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.209254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1467  hypothetical protein  43.9 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2582  hypothetical protein  30.23 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0496  hypothetical protein  38.27 
 
 
405 aa  52.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000290582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4101  hypothetical protein  37.65 
 
 
87 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1297  hypothetical protein  37.65 
 
 
87 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  32.94 
 
 
87 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3506  hypothetical protein  32.1 
 
 
526 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0495  hypothetical protein  37.8 
 
 
88 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0118149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3987  hypothetical protein  32.94 
 
 
498 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  32.94 
 
 
494 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  29.63 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21510  hypothetical protein  32.18 
 
 
89 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1335  hypothetical protein  34.48 
 
 
88 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.362868  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1145  hypothetical protein  38.2 
 
 
88 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0361475  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>