19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0341 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0341  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  673    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.209254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1275  hypothetical protein  44.65 
 
 
436 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0739014  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  39.24 
 
 
1017 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0013  hypothetical protein  38.76 
 
 
337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2067  hypothetical protein  36.52 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1772  hypothetical protein  35.1 
 
 
298 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.382301  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0311  hypothetical protein  34.43 
 
 
391 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0108  hypothetical protein  34.29 
 
 
413 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  35.37 
 
 
87 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2582  hypothetical protein  30.66 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1153  hypothetical protein  35.29 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  decreased coverage  0.0000174262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  24.34 
 
 
757 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03800  hypothetical protein  31.33 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0713  hypothetical protein  27.71 
 
 
549 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.235142  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  29.76 
 
 
87 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2567  hypothetical protein  27.13 
 
 
385 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.838539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3506  hypothetical protein  30.38 
 
 
526 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  30.59 
 
 
494 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1145  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0361475  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>