14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0935 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0935  PilT protein domain protein  100 
 
 
137 aa  268  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.827464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  63.43 
 
 
141 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000112369  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5190  PilT domain-containing protein  57.46 
 
 
137 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.745864  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5559  PilT domain-containing protein  58.96 
 
 
136 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.966422  normal  0.472394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2785  PilT protein domain protein  56.92 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.030495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7130  PilT domain-containing protein  57.14 
 
 
159 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  40.77 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  38.58 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  42.45 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  38.64 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  34.51 
 
 
137 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  34.43 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  29.7 
 
 
431 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>