19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13910 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13910  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  650    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2213  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.101715  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4355  hypothetical protein  26.2 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1775  hypothetical protein  28.57 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4659  hypothetical protein  26.04 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  31.87 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2217  hypothetical protein  25.64 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.529623  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1319  hypothetical protein  24.91 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5143  hypothetical protein  24.17 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4664  hypothetical protein  27.41 
 
 
380 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  28.75 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  28.75 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  28.75 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  24.9 
 
 
449 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4197  hypothetical protein  23.25 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2053  hypothetical protein  28.36 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0112  hypothetical protein  24.09 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000224966  decreased coverage  0.000517302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1969  hypothetical protein  22.54 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  25.26 
 
 
288 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>