17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0091 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0091  regulatory protein, MerR  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2247  regulatory protein, MerR  54.68 
 
 
147 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.032489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1678  hypothetical protein  53.57 
 
 
146 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0448  hypothetical protein  45.24 
 
 
138 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0249  hypothetical protein  37.12 
 
 
133 aa  101  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00142663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2239  flagellar protein  43.12 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0532925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0883  flagellar protein  40.15 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00624753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17170  flagellar protein  48.08 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2567  hypothetical protein  33.64 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0189  flagellar protein  41.28 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.445463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3034  flagellar protein  33.04 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3346  regulatory protein, MerR  37.33 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3231  hypothetical protein  29.2 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1332  regulatory protein, MerR  31.08 
 
 
83 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000117458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1503  YvyF  30.56 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0287  hypothetical protein  31.51 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0662  hypothetical protein  26.67 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>