29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6447 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2028  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.14 
 
 		 528 aa  647    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0712084  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2766  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.26 
 
 		 530 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6447  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 530 aa  1038    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321531  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0733  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.48 
 
 		 596 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2810  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.26 
 
 		 530 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3054  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.69 
 
 		 533 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.951228  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2756  hypothetical protein  47.56 
 
 		 551 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2657  hypothetical protein  47.72 
 
 		 526 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728518  normal  0.0923738 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18531  permease  36.28 
 
 		 533 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.632317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2322  hypothetical protein  35.14 
 
 		 589 aa  312  9e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3142  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.19 
 
 		 514 aa  299  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.097798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0005  hypothetical protein  34.39 
 
 		 531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.528166  normal  0.285686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2707  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.69 
 
 		 527 aa  276  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.458027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1746  hypothetical protein  37.73 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00122276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3202  MFS transporter xanthine/uracil permease  34.1 
 
 		 518 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4444  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.5 
 
 		 501 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13078  predicted protein  28.78 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04862  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family protein  30.87 
 
 		 533 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10988  predicted protein  27.35 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3148  sulphate transporter  28.63 
 
 		 535 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03660  hypothetical protein  25.41 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119535  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.87 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.19 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.53 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.19 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.19 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.19 
 
 		 433 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  24.61 
 
 		 443 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  25.51 
 
 		 433 aa  43.5  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>