More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0187 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0187  ISCpe5, transposase  100 
 
 
521 aa  1056    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0485  ISCpe5, transposase  100 
 
 
521 aa  1056    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  52.11 
 
 
535 aa  544  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2397  transposase ISNCY family protein  48.66 
 
 
534 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000732775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0767  ISCpe5, transposase  98.56 
 
 
222 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0429535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  38.22 
 
 
517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1154  transposase IS4 family protein  38.61 
 
 
486 aa  326  7e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.543034  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0758  ISCpe5, transposase  95.38 
 
 
154 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000330282  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1000  transposase, IS4 family protein  27.63 
 
 
536 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.309848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0350  transposase, IS4 family protein  27.63 
 
 
536 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0685  ISCpe5, transposase  91.6 
 
 
119 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0766  ISCpe5, transposase  87.5 
 
 
100 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00143398  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0686  ISCpe5, transposase  93.18 
 
 
88 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0760  ISCpe5, transposase  97.1 
 
 
88 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000148485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  25.83 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0672  hypothetical protein  38.82 
 
 
198 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  24.7 
 
 
472 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  24.7 
 
 
472 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0786  transposase IS4 family protein  25.24 
 
 
455 aa  114  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.980261  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2261  transposase IS4 family protein  25.24 
 
 
455 aa  114  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2272  transposase IS4 family protein  25.24 
 
 
455 aa  114  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1576  transposase IS4 family protein  25.24 
 
 
455 aa  114  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0562343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2464  transposase IS4 family protein  25.24 
 
 
455 aa  114  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0227  transposase IS4 family protein  25.24 
 
 
455 aa  114  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  24.6 
 
 
486 aa  113  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  24.6 
 
 
486 aa  113  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1776  transposase IS1182 family protein  25.07 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4390  transposase IS1182 family protein  25.07 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1112  transposase IS1182 family protein  25.07 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2937  transposase IS1182 family protein  25.07 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1616  transposase IS1182 family protein  25.07 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.452366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  24.4 
 
 
486 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0982  transposase, IS4 family protein  28.29 
 
 
441 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.261869  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  25.79 
 
 
497 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  25.79 
 
 
497 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0574  transposase IS4 family protein  24.62 
 
 
455 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3419  transposase IS4 family protein  24.86 
 
 
427 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3643  transposase IS4 family protein  24.86 
 
 
427 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0789536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2750  transposase IS4 family protein  24.86 
 
 
427 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3348  transposase IS4 family protein  24.86 
 
 
427 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3098  transposase IS4 family protein  24.86 
 
 
419 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3866  transposase IS4 family protein  24.86 
 
 
427 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4174  transposase IS4 family protein  24.86 
 
 
427 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1805  transposase IS4 family protein  24.86 
 
 
427 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1809  transposase IS4 family protein  24.86 
 
 
427 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0317201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  24.2 
 
 
472 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  24.72 
 
 
547 aa  107  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0759  ISCpe5, transposase  98.04 
 
 
51 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000354286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  24.55 
 
 
481 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  24.55 
 
 
481 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  24.53 
 
 
557 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  26.74 
 
 
452 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  25.07 
 
 
440 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  26.46 
 
 
452 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0697  transposase, IS4  25.68 
 
 
536 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.876809  normal  0.052348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  26.21 
 
 
445 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0009  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272991  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0072  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.173128  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0183  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0269  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.464686  normal  0.0269922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0350  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0387  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0612523  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0412  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185935  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0439  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0484  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0590  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.366891  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0628  transposase, IS4  25.48 
 
 
536 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378407  normal  0.227693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>