More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1734 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1734  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  5.27786e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1160  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0165656  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2178  tRNA-Asp  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2182  tRNA-Asp  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.520938  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1156  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00893597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1738  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  4.57664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2219  tRNA-Asp  98.7 
 
 
79 bp  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2259  tRNA-Asp  98.7 
 
 
79 bp  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  98.46 
 
 
77 bp  121  2e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0027  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245958  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  3.70726e-05  hitchhiker  2.54524e-07 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0027  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  2.48152e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  95.38 
 
 
79 bp  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0041  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  3.25058e-05  normal  0.507644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0039  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  2.26797e-14  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0026  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  2.21306e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0029  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0847414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0021  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252162  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  96.72 
 
 
74 bp  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0027  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239727  normal  0.0594729 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0014  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.469751  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0022  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.52228e-07  hitchhiker  3.53756e-06 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0514  tRNA-Asp  94.03 
 
 
74 bp  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.30376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0054  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  3.38252e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0054  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  5.52526e-07  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0054  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.66349e-08  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0052  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.41383e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0037  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.02957e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0028  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00318123  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0511  tRNA-Asp  94.03 
 
 
74 bp  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.304577  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0096  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  4.96509e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1589  tRNA-Asp  96.55 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.153421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0603  tRNA-Asp  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508716  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0599  tRNA-Asp  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2041  tRNA-Asp  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  93.85 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  8.08447e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0054  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0039  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0037  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0056  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.299906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0019  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0178689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0036  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227491  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0037  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451566  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0038  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352364  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0055  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.297696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2040  tRNA-Asp  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  93.85 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  3.2409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA30  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000254834  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0066  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111209  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t46  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t47  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R37  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835448  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R28  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  7.71602e-05  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R26  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223241  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0021  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0103753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA29  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  8.2024e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t49  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0067  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168888  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA27  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237638  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0062  tRNA-Asp  92.75 
 
 
74 bp  97.6  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  8.66023e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R38  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809466  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0021  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  4.52524e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0085  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150257  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0060  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0314851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0059  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0311409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0083  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0068  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242521  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1860  tRNA-Asp  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000224596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0012  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0021  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.76663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0066  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.09987e-08  hitchhiker  1.03719e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0119  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0531426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0137  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0050  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  2.96648e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0047  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000429092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0004  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0008  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0080  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  8.1344e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0004  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.660889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0047  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.77067e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0005  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.128453  unclonable  1.12956e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0177  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0067  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.56523e-07  hitchhiker  9.93702e-07 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0153  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.44373e-07 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0159  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00117614  hitchhiker  3.16845e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0139  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.595909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0114  tRNA-Asp  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>