26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0147 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  100 
 
 		 354 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.11 
 
 		 348 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.11 
 
 		 348 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.53 
 
 		 348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  44.8 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  45.48 
 
 		 360 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.24 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  42.11 
 
 		 347 aa  285  8e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.64 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.24 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  43.53 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.71 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  42.61 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.71 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.41 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  41.18 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  35.88 
 
 		 352 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.83 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  40.11 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  38.81 
 
 		 353 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  35.31 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  36.39 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  33.72 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  37.28 
 
 		 302 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.17 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  20.82 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>