29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0060 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0060  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3586  hypothetical protein  74.56 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284376  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4252  hypothetical protein  66.67 
 
 		 114 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122458  decreased coverage  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4776  hypothetical protein  66.67 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0832  hypothetical protein  65.79 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3095  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3060  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2007  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.17329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2606  hypothetical protein  65.49 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0773  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3007  hypothetical protein  65.77 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4220  hypothetical protein  55.66 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4837  hypothetical protein  44.95 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1850  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1069  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.443207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1359  hypothetical protein  36.21 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.147484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2769  hypothetical protein  32.46 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6200  hypothetical protein  33.93 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.484468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0400  hypothetical protein  35.45 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7213  hypothetical protein  29.73 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1177  hypothetical protein  29.91 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.174378  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1180  hypothetical protein  33.04 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1254  hypothetical protein  32.17 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2447  hypothetical protein  33.04 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.950659  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1236  hypothetical protein  32.73 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6596  hypothetical protein  32.73 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7085  hypothetical protein  32.73 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0138  hypothetical protein  32.74 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.096273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1695  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>