13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5346 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5346  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  233  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3426  hypothetical protein  99.11 
 
 		 124 aa  233  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4942  hypothetical protein  99.11 
 
 		 124 aa  233  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140936  unclonable  0.0000158871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0749  hypothetical protein  91.89 
 
 		 166 aa  214  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4399  hypothetical protein  80.36 
 
 		 112 aa  194  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  44.23 
 
 		 683 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0081  hypothetical protein  52.38 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.824718 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  51.28 
 
 		 254 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  52.94 
 
 		 644 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  48.89 
 
 		 388 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  48.89 
 
 		 388 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  44.74 
 
 		 643 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  44.64 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>