17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4310 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4310    100 
 
 		 165 bp  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180481  decreased coverage  0.0000000234617 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  97.3 
 
 		 1146 bp  262  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  93.67 
 
 		 1134 bp  234  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3255    93.59 
 
 		 720 bp  230  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3170    92.95 
 
 		 156 bp  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  81.51 
 
 		 1146 bp  75.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  88.24 
 
 		 1176 bp  71.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  88.24 
 
 		 1176 bp  71.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  88.24 
 
 		 1143 bp  71.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  86.76 
 
 		 1143 bp  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  86.76 
 
 		 1143 bp  63.9  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  86.76 
 
 		 1143 bp  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  85.29 
 
 		 1143 bp  56  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  90.48 
 
 		 1155 bp  52  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  96.55 
 
 		 1155 bp  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  96.55 
 
 		 1155 bp  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  89.74 
 
 		 1161 bp  46.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>