More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_R0031 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_R0041  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  7.66368e-14  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1694  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  6.55651e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2777  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  1.32175e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  7.33307e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  2.19995e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1828  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  4.01968e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1827  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  3.83141e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2877  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  8.3016e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0033  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.06516e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2876  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  6.08308e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2778  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  1.36224e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0039  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  6.83779e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0067  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2815  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  6.87096e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2933  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.03893e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2934  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.07091e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2816  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  2.13443e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1695  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  3.9183e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2505  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  3.58439e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2504  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  2.20613e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0034  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  9.27259e-12  normal  0.865314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0053  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.46858e-10  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0052  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  7.7031e-13  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0033  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  3.48439e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0034  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  1.29233e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0031  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  4.20525e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0032  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  3.99959e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0015  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  9.0416e-06  normal  0.096467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0034  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  8.16877e-12  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS04000  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  2.34259e-08  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0033  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.61489e-08  normal  0.861574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0039  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0012  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00139972  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0017  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  4.97879e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0018  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  3.18687e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0034  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.25096e-09  normal  0.395781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0033  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.24831e-08  normal  0.39291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0041  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.56611e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0042  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.18155e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0044  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  143  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.975167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0036  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  143  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0058  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  143  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0204591  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0041  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.36051e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0040  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.58111e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0040  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345644  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0039  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.480095  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0049  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0031  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0059  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  8.63176e-11  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0058  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.61243e-12  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0040  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0029  tRNA-Asn  97.14 
 
 
76 bp  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0902412  normal  0.0228096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0030  tRNA-Asn  97.14 
 
 
76 bp  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0031  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  6.43005e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0039  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  2.27587e-09  normal  0.0269838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0031  tRNA-Asn  95.83 
 
 
76 bp  119  1e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0046  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.52879e-06 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0028  tRNA-Asn  95.83 
 
 
76 bp  119  1e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546995  normal  0.0230083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0073  tRNA-Asn  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0031  tRNA-Asn  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0072  tRNA-Asn  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0029  tRNA-Asn  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25599  normal  0.694984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0074  tRNA-Asn  95.71 
 
 
76 bp  115  1e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0048  tRNA-Asn  95.31 
 
 
76 bp  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.54401  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0003  tRNA-Asn  90.67 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.29793e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0030  tRNA-Asn  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  8.64029e-13  hitchhiker  4.18087e-06 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0031  tRNA-Asn  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  7.81489e-13  hitchhiker  6.92381e-07 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  2.73116e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  92.98 
 
 
73 bp  81.8  2e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  92.98 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.44354e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0014  tRNA-Lys  88.57 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647386  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  91.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  6.72543e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  91.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.1783e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  91.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.81863e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  93.88 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.7985e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  93.88 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.26187e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  91.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.68933e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2892  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  1.82855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2891  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  1.94238e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0026  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248666  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0079  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  5.05976e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1988  tRNA-Asn  87.5 
 
 
78 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0027  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.75485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0046  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2890  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  2.00194e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2889  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  1.82855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0021  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503528  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0004  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0077  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  4.77509e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0076  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515739  normal  0.421083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>