33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4894 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  59.17 
 
 		 555 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  93.14 
 
 		 539 aa  1003    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  94.81 
 
 		 539 aa  1019    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  59.82 
 
 		 556 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  99.63 
 
 		 539 aa  1083    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1087    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  93.14 
 
 		 539 aa  1001    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1087    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  53.2 
 
 		 540 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  53.2 
 
 		 540 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  53.38 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  53.38 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  43.91 
 
 		 550 aa  379  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  33.81 
 
 		 536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  38.89 
 
 		 543 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 		 487 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  38.22 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 		 583 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  38.18 
 
 		 562 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  35.61 
 
 		 580 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2225  hypothetical protein  77.59 
 
 		 58 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.444853  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1929  hypothetical protein  77.59 
 
 		 58 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1722  hypothetical protein  77.59 
 
 		 58 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1656  hypothetical protein  77.59 
 
 		 58 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2308  glycine/D-amino acid oxidases  75.86 
 
 		 58 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0705  hypothetical protein  77.36 
 
 		 53 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1655  hypothetical protein  72.73 
 
 		 87 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1930  hypothetical protein  72.73 
 
 		 36 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1723  hypothetical protein  72.73 
 
 		 36 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2307  hypothetical protein  69.7 
 
 		 87 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2224  hypothetical protein  66.67 
 
 		 87 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>