24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1429 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1429  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24020  uncharacterized HhH-GPD family protein  73.33 
 
 		 194 aa  265  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1417  HhH-GPD family protein  74.01 
 
 		 190 aa  261  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.358135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4049  HhH-GPD  71.43 
 
 		 193 aa  254  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0272645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4278  HhH-GPD family protein  71.43 
 
 		 193 aa  254  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4124  HhH-GPD family protein  71.43 
 
 		 193 aa  254  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293882  normal  0.585428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4556  HhH-GPD family protein  66.49 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363897  normal  0.250068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11180  hypothetical protein  65.36 
 
 		 195 aa  238  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.838614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2147  HhH-GPD family protein  65.52 
 
 		 194 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00539859  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0384  HhH-GPD family protein  64.94 
 
 		 195 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2883  HhH-GPD family protein  65.17 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0249  HhH-GPD family protein  62.07 
 
 		 194 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1142  HhH-GPD family protein  63.54 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3780  HhH-GPD family protein  63.07 
 
 		 197 aa  209  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224351  normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3560  HhH-GPD family protein  60.33 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487584  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1408  HhH-GPD family protein  56.74 
 
 		 196 aa  197  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6604  HhH-GPD family protein  52.13 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7074  HhH-GPD family protein  54.19 
 
 		 193 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.749596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2526  HhH-GPD  52.57 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1433  HhH-GPD family protein  53.23 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.638307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3342  HhH-GPD family protein  58.05 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2964  HhH-GPD family protein  53.48 
 
 		 188 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.921291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0712  HhH-GPD family protein  50 
 
 		 195 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5036  HhH-GPD family protein  40.1 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  0.0580074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>