37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4274 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  58.63 
 
 		 555 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  97.96 
 
 		 539 aa  1050    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  92.95 
 
 		 539 aa  1001    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  93.14 
 
 		 539 aa  1000    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  59.75 
 
 		 556 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  93.14 
 
 		 539 aa  1001    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  93.14 
 
 		 539 aa  1001    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1083    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  53.75 
 
 		 540 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  53.75 
 
 		 540 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  53.75 
 
 		 540 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  53.75 
 
 		 540 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  43.36 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  33.81 
 
 		 536 aa  299  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  39.31 
 
 		 543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 487 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  38.51 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  37.6 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  36.48 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  35.07 
 
 		 580 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2225  hypothetical protein  77.59 
 
 		 58 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.444853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1722  hypothetical protein  77.59 
 
 		 58 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1929  hypothetical protein  77.59 
 
 		 58 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1656  hypothetical protein  77.59 
 
 		 58 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2308  glycine/D-amino acid oxidases  75.86 
 
 		 58 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0705  hypothetical protein  77.36 
 
 		 53 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 426 aa  47.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1655  hypothetical protein  69.7 
 
 		 87 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  33.1 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  34.21 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  33.1 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  33.1 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1930  hypothetical protein  69.7 
 
 		 36 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1723  hypothetical protein  69.7 
 
 		 36 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  31.5 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2307  hypothetical protein  66.67 
 
 		 87 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 361 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>