18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3278 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3278  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2991  hypothetical protein  63.46 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.310456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1089  hypothetical protein  61.54 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2219  hypothetical protein  51.79 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1035  hypothetical protein  56.86 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0008  hypothetical protein  50.82 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0739  hypothetical protein  47.54 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3220  hypothetical protein  50.98 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1615  hypothetical protein  50.98 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0173  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0011  hypothetical protein  44.93 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3615  hypothetical protein  49.02 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3492  hypothetical protein  49.02 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.176609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3019  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189985  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5112  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1708  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.118644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3292  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307693  normal  0.843731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4508  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>