16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1727 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0749  hypothetical protein  62.75 
 
 		 111 aa  135  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4057  hypothetical protein  55.86 
 
 		 111 aa  120  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0486506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0725  hypothetical protein  48.04 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3258  hypothetical protein  46.85 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317122  normal  0.791915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0270  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0035  hypothetical protein  43.69 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.525352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2886  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1792  hypothetical protein  32.5 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5911  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116094  decreased coverage  0.00152039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1872  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2913  hypothetical protein  26.25 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1947  transcriptional regulator, ArsR family  27.85 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1838  LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 122 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  25.81 
 
 		 339 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>