18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2886 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2886  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 120 aa  246  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23508  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5911  LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116094  decreased coverage  0.00152039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0035  hypothetical protein  31.19 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1872  LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1947  transcriptional regulator, ArsR family  28.81 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2057  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4057  hypothetical protein  32.71 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0486506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0270  hypothetical protein  34.58 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3258  hypothetical protein  36.11 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317122  normal  0.791915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1088  hypothetical protein  28.04 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0725  hypothetical protein  32.71 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1727  hypothetical protein  34.52 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2168  LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1838  LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2663  hypothetical protein  29.29 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.525352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3428  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  27.42 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>