18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0035 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0035  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  239  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3258  hypothetical protein  44.23 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317122  normal  0.791915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0749  hypothetical protein  44.04 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0725  hypothetical protein  42.73 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0270  hypothetical protein  44.23 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4057  hypothetical protein  40.37 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0486506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1727  hypothetical protein  43.69 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2886  transcriptional regulator, ArsR family  31.19 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1947  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2663  hypothetical protein  32.53 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.525352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  27.96 
 
 		 339 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1792  hypothetical protein  30.53 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1872  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5911  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116094  decreased coverage  0.00152039 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2913  hypothetical protein  27.91 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1088  hypothetical protein  33.72 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1268  group I intron GIY-YIG endonuclease  30.38 
 
 		 253 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1442  group I intron GIY-YIG endonuclease  30.38 
 
 		 253 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000749495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>