17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2663 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  238  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.525352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1792  hypothetical protein  49.12 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2913  hypothetical protein  43.36 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1088  hypothetical protein  38.14 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0725  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0749  hypothetical protein  33.04 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1727  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0035  hypothetical protein  32.53 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317122  normal  0.791915 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5911  LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116094  decreased coverage  0.00152039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4057  hypothetical protein  34.12 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0486506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1838  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  31.91 
 
 		 339 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0270  hypothetical protein  28.71 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1872  LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1947  transcriptional regulator, ArsR family  26.25 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2886  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>