21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3258 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3258  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317122  normal  0.791915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0749  hypothetical protein  48.6 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1727  hypothetical protein  46.85 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0035  hypothetical protein  44.23 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4057  hypothetical protein  55.56 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0486506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0725  hypothetical protein  40.37 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0270  hypothetical protein  38.74 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2886  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 339 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.525352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1792  hypothetical protein  33.73 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1872  LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1838  LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2168  LuxR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5911  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116094  decreased coverage  0.00152039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1088  hypothetical protein  27.27 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2057  LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1947  transcriptional regulator, ArsR family  29.33 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2913  hypothetical protein  28.57 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1268  group I intron GIY-YIG endonuclease  29.27 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1442  group I intron GIY-YIG endonuclease  29.27 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000749495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>