More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0005 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_Se16SA  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1554 bp  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SB  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1554 bp  664    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SC  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1554 bp  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SD  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1554 bp  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SE  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1554 bp  648    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1554 bp  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0060  16S ribosomal RNA  99.08 
 
 		 1515 bp  2886    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0001  16S ribosomal RNA  99.27 
 
 		 1515 bp  2910    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.792854  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SA  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1551 bp  666    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SB  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1551 bp  666    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SC  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1551 bp  666    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SD  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1551 bp  666    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SE  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1551 bp  666    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SF  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1551 bp  666    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SG  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1551 bp  666    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0070  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1545 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  82.72 
 
 		 1521 bp  704    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0017  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1545 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00979758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0017  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1555 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000010305  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0020  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1555 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 1521 bp  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0005  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1555 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.535884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0067  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1562 bp  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0081  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1562 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0081  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1545 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.621558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0070  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1562 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0067  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1545 bp  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0021  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1545 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 1521 bp  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0005  16S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 1545 bp  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.328307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 1521 bp  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0031  16S ribosomal RNA  98.88 
 
 		 1514 bp  2855    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0005  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1516 bp  3005    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 1612 bp  634  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 1612 bp  634  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 1612 bp  634  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 1612 bp  634  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1612 bp  626  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1612 bp  626  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1612 bp  626  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 1612 bp  626  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1548 bp  624  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1548 bp  624  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1548 bp  624  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1548 bp  624  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1548 bp  624  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1548 bp  624  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1431 bp  599  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1466 bp  599  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1466 bp  599  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1431 bp  591  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 		 1545 bp  587  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1545 bp  579  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0008  16S ribosomal RNA  81.31 
 
 		 1479 bp  545  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0005  16S ribosomal RNA  81.31 
 
 		 1479 bp  545  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1522 bp  464  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1517 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1518 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1518 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1522 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 1517 bp  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  83.13 
 
 		 1522 bp  448  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1784  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1550 bp  426  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0409  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1550 bp  426  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0181  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1550 bp  426  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0019  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1550 bp  426  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0079  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1550 bp  426  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.940903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0168  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1550 bp  426  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1554 bp  424  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1554 bp  424  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1671 bp  424  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1554 bp  424  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1661 bp  424  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0006  16S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 1558 bp  420  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000369599  normal  0.665449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0039  16S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 1558 bp  420  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000267916 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1544 bp  418  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0095  16S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 1559 bp  416  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00647588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>